A Secretaria Acadêmica é o órgão encarregado de implementar todas as ações inerentes ao desenvolvimento acadêmico e apoio logístico aos cursos da FIBRA, estando vinculada diretamente à Diretoria Acadêmica. Algumas de suas atribuições são listadas  a seguir:

• Expedir e registrar diplomas e certificados;
• Expedir e assinar ofícios, circulares e documentação pertinentes, visados pela Diretoria Acadêmica;
• Realizar o controle e o registro acadêmico;
• Coordenar o planejamento e da execução das matrículas;
• Prestar apoio e assistência aos Coordenadores de Cursos;

Históricos escolares, certidões, atestados, declarações e outros documentos referentes à situação acadêmica dos alunos são fornecidos unicamente pela Secretaria Acadêmica e devem ser solicitados com antecedência mínima de 48h, por meio de requerimento próprio.